В одном из виртуальных игровых миров, законы которых знакомы зрителю по сериалу .hack//sign, начинают происходить необъяснимые системные ошибки. На уровне для новичков появляются вдруг сильнейшие монстры. Эти же монстры чудесным образом регенерируют, несмотря на смертельные удары, нанесенные опытными игроками. Так наступают Сумерки Мира...

Ничего не ведая о происходящем, в игру входят двое новых игроков - это близнецы, родители которых разошлись, и таким образом развели брата и сестру по разным домам. Теперь единственное место встречи для детей - это Мир, где живут их персонажи - Кэйт и Роза - копии образов легендарных защитников Мира. Никто не догадывается, что победа в розыгрыше этих двух фигур была изначально подстроена духом-хранителем Мира - Аурой. Более того, таинственная Аура вручает Кэйту загадочный Браслет Сумерек, способный уничтожать неуправляемых "ошибочных" монстров. Героям и их друзьям предстоит защитить Мир. А зрителю уготовлено прямо или косвенной встретиться с уже знакомыми персонажами и заново пройти вместе с ними по старым и новым веткам игры.

Сериал не является непосредственным продолжением .hack//sign, однако очевидно, что описанные в .hack//dusk события происходят позднее. Имеются также упоминания о приключениях, показанных в .hack//sign.